為進一步加強和規范“三費一款”（訴訟費、鑒定費、執行費、執行履行款）的管理和監控，堵塞“三費一款”管理漏洞，蘇州中院在省法院有關部門的支持下，對原有的《人民法院綜合信息管理系統》軟件進行了修改和完善，從而使該院在全省法院率先將“三費一款”納入審判流程管理，保證了“三費一款”收取、退費等環節的公開、公正、廉潔、高效。 
    修改后的《人民法院綜合信息管理系統》軟件在“三費一款”管理上主要發揮以下幾個方面的功能：一是增加了“三費一款”查詢模塊。立案庭和財務室可以隨時查看和掌握“三費一款”的收取、退費和減緩免等情況，發現問題及時糾正。二是加強了執行費和執行履行款物的管理。在執行案件的軟件設計上，增加了財產控制登記表，對執行款物的控制、處分以及收、退情況逐項進行登記，立案庭和財務室隨時跟蹤執行款物的處分情況，實施有效監控。三是完善了鑒定費的管理。修改后的軟件，增加了“司法鑒定”、“鑒定立案”、“鑒定期限”模塊，在對司法鑒定案件實行流程管理的同時，加強了對申請鑒定、審計、評估、拍賣等案件的費用收、退情況的監控。